早在《刺杀骑士团长》这本书还未在中国出版的时候，就有听说关于其中“南京大屠杀”的描述，如村上春树这样的日本知名作家能够在作品中对这一事件进行承认和反省，必然是极好的。然而这本书并非是一本考察历史的书籍，就如作者所说的，并不深究屠杀40万与屠杀10万这样数字上的区别，但屠杀的恶的本质是不会改变。
也许艺术家与疯子在某种程度上是接近的：作者以第一人称的视角，我，去描述一个近似一个玄幻故事。
主人公是一个热爱抽象画的的画家，却因为生活所迫而画肖像画谋生，所幸精湛的技艺使他业界颇具名声。然而，毫无征兆的，妻子向他提出了了离婚（也许只是他神经大条未发现征兆）。六年始终如一的平静的规律的生活被打破，也许是生活上的不幸，但是也成为自己在追求自己理想的一个契机。在一段漫长的漫无目的自驾游旅行之后，他推掉了肖像画的工作，寄居在美大时候一位朋友父亲，著名日本画画家雨田具彦家里，位于偏僻的山上。彼时，雨田具彦因为年老痴呆，住进了疗养院。
一副画引发了“血案”：一次偶然的机会，他在房间的阁楼上发现了雨田具彦的画，如本书的题目，雨田命名为《刺杀骑士团长》。这幅画的不可思议之处，引起了主人公的好奇，他开始试图了解这幅画的创作历史，和雨田具彦的平生。而以一个社交关系很少的画家，这无论如何都是极为困难的，这时候，出现了这本书的第二号人物，有奇特姓氏的免色先生。免色通过某种途径，花费足以使他动心的报酬，让他给自己画肖像画，于此同时，这位富有，偏执，而且同样充满好奇心和规划的人，开始使故事变得复杂起来。
在这之前的故事还算是正常，直到在为免色画肖像画的某一天夜里，在某一固定的时刻，山上小庙的后面石头底下总会有铃声响起，这使得主人公深感困惑，在免色的帮助下，他们挖开了石堆，底下是一个高约3m的圆形石室，里面只有一个古铃。这之后，一个自称理念的东西，显现为骑士团长的模样，出现了。从这里开始，故事变得玄幻了起来。
日本传统文化中有很多妖神，但是就算持有万物有灵的观点的人，也无法想象理念作为一个神灵这样的东西出现的吧，而这个自称理念的东西，有究竟是什么样的理念，他是否是主人公在转变画风风格的时候，出现在其大脑中的一种东西，通过精神病人的视野，将其描述出来呢，未可知。
雨田的经历不断被免色发掘出来——纳粹德国时候在维也纳留学的经历，弟弟在侵华战争时服兵役，退役后自杀的家族往事，似乎这幅画的背景渐渐清晰。而在这一线索的背后，另一条线索也在暗自发展。免色的计划，或者说他从未承认这是计划正在进行。免色委托了他第二幅画，画一个疑似自己女儿的13岁小姑娘秋川真理惠的画。总之免色也是一个有着怪异思维的人。
故事发展到第二篇流变隐喻篇，几乎没有看懂。主人公在痴呆的雨田具彦面前表演了杀死骑士团长，之后进入了另一维空间，在这个抽象的世界里躲过隐喻的吞噬，重新回到人间。隐喻是抽象画锁具有的特征，是否意味着作者杀死了自己新的理念，放弃抽象画的理想，对人生价值有了重新的认识？通过这一旅程的而考验，救了溜进免色家的小姑娘。这段经历要说明什么，与找到失踪的秋川真理惠又是怎样联系的，总觉得不可思议。
故事最后，经历过这些的主人公与妻子重修旧好，又开始画肖像画。而免色似乎也达成了什么计划，秋川真理惠过着一如既往的生活。那幅刺杀骑士团长的画，与自己的白色斯巴鲁男子的画，在一场火灾中失去。
在这本小说中，同样看到了作者奇异的生活理念：遵守游戏规则的人妻女友，通过情念让远方妻子受孕的想法，与1q84极为相似。
故事在某方面来说是稀奇古怪的，但作者总能通过节制的表达，使得句子变得十分有意味而不显得哗众取宠，在这一点上，令人敬佩。
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